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运动神经元病是世界上一个比较难治的疾病，治疗方法研究了几十年，但是最新的治疗方法并不是太多。从目前来看出现比较晚的治疗，如经颅磁刺激，是一种神经调控的方法，主要是用磁场作用在大脑皮层上，改善脑细胞生长，改善神经细胞生长因子，从而来达到改善患者症状的目的。但是这种治疗不能从根本上治愈运动神经元病，只能延缓症状，改善症状。疾病的整个病程要不断地进行发展，只是发展变慢了，或者停滞一段时间。从药物角度来讲，更新的治疗其实没有，基本上也是停留在过去的药物，如利鲁唑，商品名叫力如太，还有日本有一种药物，他们叫依达拉奉输液治疗。另外运动神经元病有医院在尝试新的疗法，但是都是个体化的小单位进行研究，不具有普遍性。如部分在用青霉素，部分在用头孢类抗生素治疗，但是都没有临床推广意义。