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肠胃炎吃头孢还是阿莫西林，需依据病因决定。若肠胃炎并非由于细菌感染而引起，则患者无论头孢还是阿莫西林均无法服用。而存在病毒感染的情况下，患者也无需服用药物，否则会引起肠道菌群失调，从而加重肠胃炎情况。若患者是由于细菌感染而引起的肠胃炎，应进行大便培养及药物敏感试验，观察患者对于头孢、阿莫西林的敏感情况。若患者对两者均敏感，可根据药物的价格、可及性、过敏史、药物剂型及服用方法等综合考虑。少数患者会出现阿莫西林过敏，表现为起皮疹、皮肤发痒及黏膜水肿，此时患者应尽量避免选择阿莫西林治疗细菌性肠胃炎。