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女性怀孕40天，主要的注意事项具体如下：1、避免射线刺激：女性怀孕40天时，应注意避免X线等射线因素，这些为公认明显导致胎儿畸形的情况。若女性不能确定是否怀孕且有停经史，到医院时应特别注意，尤其需避免做CT、拍X片、拍胸透等接触射线的检查；2、避免药物刺激：女性怀孕40天应注意不随意服用药物，包括减肥药、中药等。综上，女性在怀孕40天时，为胚胎分化、发育较敏感的时期，若此时外界对胚胎有较严重的直接刺激，如药物、X线以及其他物理、化学、环境刺激，易导致胚胎出现畸形，导致流产、畸形儿。故女性怀孕40天时，应密切注意上述因素对胎儿的刺激作用。