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咽喉炎通常由病毒或细菌感染引起。部分病毒感染的咽喉炎可传染，如奋森氏咽峡炎，由特殊类型病原菌感染引起，有一定传染性。细菌感染一般不具有传染性，要根据不同情况进行相应预防。少数病人会发生真菌感染，真菌感染一般不具有传染性，咽喉部真菌感染多是由于患者机体免疫功能低下，或局部应用特殊药物，影响局部黏膜功能，尤其是防御功能，从而导致感染或继发感染。不同病原菌的感染，应采用不同的治疗方法。