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胃肠道间质肿瘤通过及时治疗能治疗好，但是其也跟肿瘤的良恶性相关，治疗及时，预后会更好，具体如下： 1、良性胃肠道间质瘤通过手术切除可以彻底治愈，术后没有问题； 2、恶性间质瘤如果需要治疗，需结合其恶性程度、肿瘤分期，个人体质有没有淋巴结转移、脏器转移、手术能否彻底切除，以及术后其对格列卫等相关的化疗药物敏感性来判定其预后。综上所述，一般胃肠道间质肿瘤的治疗及时，会取得良好结果。部分晚期或者治疗不及时会造成肿瘤复发转移的患者，治疗较麻烦，而且后果不好。所以早期诊断、早期治疗，就会有更好的临床结果。