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胆结石引起肝功能异常的治疗主要是针对胆结石来采取治疗。具体如下：1、胆囊结石急性发作：如果炎症累及肝脏会出现肝功能异常，或者是胆囊内结石掉入胆囊管引起胆道梗阻、胆汁淤积，继而出现黄疸和肝功能异常。无论是哪种情况都建议尽早通过外科手术干预，包括胆囊切除以及胆管切开取石来恢复胆道的通畅性、减少胆囊及胆管炎症对于肝脏的损伤，可以较大限度地改善肝脏功能；2、慢性胆囊结石：慢性胆囊结石引起的慢性胆囊炎或者是无症状胆囊结石通常不会合并肝功能异常，如果体检的时候发现转氨酶异常升高，则需要考虑是否有其他疾病，包括病毒性肝炎、长期饮酒、严重脂肪肝、某些药物以及自身免疫性肝脏疾病引起的肝功能异常。此种肝功能异常不是由于胆囊结石引起，而需要根据具体的病因来采取相应的其他药物治疗。