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理论上当免疫系统足够强大，能够杀灭足部的病毒时，跖疣有可能自愈，但很少见。跖疣本质上是HPV病毒，即人乳头瘤病毒感染所导致的皮肤损害，与免疫系统之间存在平衡关系，当病毒较强时，就会导致损伤，当机体免疫功能更强时，则可能有自愈的可能。但是在临床实践中，大部分跖疣患者需要通过治疗来得到好转，最常用冷冻疗法，即利用液氮的超低温将局部的细胞和病毒一起杀死，才能够得到彻底治愈的效果。冷冻治疗的治愈率较高，大部分都在90%或者95%以上。如果患者不愿意做冷冻治疗，也可以尝试药物治疗，但有效率较低。