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脑静脉血栓治疗与动脉治疗有所区别，治疗脑静脉血栓，一般需要进行相关血管检查，用抗凝药物治疗，急性期可以服用低分子肝素治疗，但要避免使用脱水剂和止血药物，因为部分脑静脉血栓形成后，会造成局部肿胀导致出血，这时应用止血药物和脱水剂可能增加血液黏稠度，导致血栓加重。一般脑静脉血栓常见于静脉窦血栓，因为静脉窦没有弹性以及窦瓣，血液可以双向流通，血流缓慢时容易造成静脉窦血栓，这时给予低分子肝素足疗程治疗，可以有效打通静脉血栓。通过治疗以后，患者需要随访，如进行磁共振、血管造影，避免血管栓塞复发。患者可能还需要服用一段时间抗凝药物，包括华法林、达比加群酯和利伐沙班等，改善因为血栓或者凝血功能升高引起的症状。