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畸胎瘤的发生部位可以是胸腔、腹腔、盆腔、骶尾部等中线部位，还包括性腺，如卵巢和睾丸。如果儿童畸胎瘤的发生部位不是性腺，通常对生育没有影响。但如果某些极端的情况，如双侧的卵巢和睾丸发生肿瘤，可能影响生育，常见情况如下：1、双侧卵巢均存在恶性肿瘤的女孩，经过手术治疗后，双侧卵巢可能被去除，从而影响生育；2、双侧睾丸肿瘤的男孩，相对罕见的极端情况，也可能影响生育；3、治疗恶性肿瘤时可能使用大剂量的环磷酰胺，可能对男孩睾丸，以及生精细胞造成影响，可能导致男孩发生无精子症，也可能影响生育。生育是较为复杂的问题，部分人既没有发生过畸胎瘤或其它肿瘤，也有可能无生育能力。因此不代表存在卵巢和睾丸，便能够生育。