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呼吸系统疾病最常见的原因还是感染性疾病，也就是由病原体感染所造成的疾病，如上呼吸道感染、普通感冒、急性气管支气管炎、肺炎等疾病，在我国肺结核也非常常见。除了感染性疾病，还有非感染性疾病也是呼吸道疾病的原因，如慢性阻塞性肺疾病、慢性支气管炎、支气管扩张、过敏性肺炎、间质性肺疾病、肺部肿瘤，都是呼吸系统疾病的常见原因。呼吸系统疾病是一个很大的范畴，可以由呼吸系统疾病本身造成，也可以是全身疾病的反应，如结缔组织病也可以在呼吸系统形成损伤，还有血液系统也可以以呼吸系统的症状为表现，比如血管炎等疾病。所以呼吸系统疾病是多方面的原因，有呼吸系统本身的原因，也可以有全身系统疾病的呼吸系统表现。