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由于患者尿液浓度相对较高，进而尿液中有溶质，如结石结晶或者尿酸原本溶解在尿液中的成分，因浓度过高而沉积，表现为肾脏中有结晶体出现。结晶可以有各种成分，较常见形成结石成分的结晶，如草酸钙、碳酸钙。此外，对于存有特殊代谢情况或特殊疾病患者，如高尿酸血症或痛风患者，可出现尿酸结晶现象。患者有胱氨酸代谢异常，尿液中胱氨酸浓度过高后即可形成结晶，在肾脏集合系统沉积。因此，结晶实际属于结石早期表现。