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男性泌尿系统疾病的病因是一个比较广泛的范畴，因为在泌尿外科，泌尿系统的常见疾病包括泌尿系统的感染、结石、结核、肿瘤、畸形、损伤以及血管问题等，具体如下：1、泌尿系统感染：一般是由细菌感染引起，感染的方式为逆行感染、血行感染或者直接蔓延，以逆行感染最为多见。除细菌感染，还可见于其他病原微生物的感染，如支原体、衣原体；2、泌尿系统结核：需要注意一些特异性的感染，最常见的特异性感染就是泌尿系统结核，属于结核杆菌的感染引起，为血行感染，通常会感染肾脏而引起下尿路结核的发生；3、泌尿系统结石：也是一个常见的疾病，但发病病因比较复杂，通常是由于外界因素、个体因素、泌尿系统因素的共同作用，使尿液中的成石因素增加，而抑石因素减弱，从而导致尿液中有形成成分析出，继而引起结石的发生；4、泌尿系统肿瘤：其发病病因更为复杂，泌尿系统肿瘤最常见的包括肾癌、膀胱癌和前列腺癌，这是位于前3名的泌尿系统肿瘤。肿瘤的发生病因目前并不清楚，一般认为外界因素与内在的基因变化相关；5、泌尿系统畸形：畸形一般是由于先天性或者遗传性的因素，而导致泌尿系统发育异常引起；6、泌尿系统损伤：顾名思义就是由于外伤所导致的泌尿系统问题。