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肛窦炎，是肛隐窝、肛门腺的急慢性的炎症性的感染病，其病理组织改变是局部的充血水肿、组织增生。肛窦炎发病因素有三个，首先是感染损伤，干结的粪便因摩擦损伤肛腺，导致粪便淤积、细菌繁殖，从而导致肛腺的感染；其次是胚胎发育的影响，肛周脓肿、肛瘘的肛隐窝比正常人深，数量较多，增加肛腺感染的机会；第三是性激素的影响，性激素调节肛腺的发育和功能的完善，直接影响肛腺的萎缩和增生，导致肛窦炎。