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磁共振是发现中枢器质性病变的重要手段，中枢神经系统的器质性病变又是导致儿童中枢性性早熟的重要病因。因此，对6岁以下或6-8岁进展较快的中枢性性早熟女孩和所有已确诊为中枢性性早熟男孩，都应常规进行头颅部的磁共振检查，以明确有无颅内器质性病变。常规CT平扫难以发现颅内的微小病变，甚至是一些较大的瘤体，与儿童性早熟有关的肿瘤又多数发生在蝶鞍区。所以在此区域应作增强分层检查，以提高诊断的准确率。