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食管癌超声内镜适用于局限在黏膜和黏膜下层的早期肿瘤，以及未合并淋巴结转移的患者，即通过CT检测，未发现纵隔、腹腔及颈部锁骨上淋巴结转移者。超声内镜可用来观察有无黏膜下淋巴结转移及判断肿瘤能否切除完整，术前做超声内镜可对食管癌进行较为正确的判断。较早期食管癌可以选择超声内镜治疗，切除病变，肿瘤一旦超过黏膜下层甚至肌层，不推荐患者选择超声内镜，建议胃镜检查并活检，选择外科治疗。