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肛周脓肿根治性切除术后大约4-6周愈合，具体愈合时间与脓肿部位、大小及患者体质有关。该病由于肛门腺腺体感染引起，治疗肛周脓肿过程中，须尽快寻找脓肿来源，进行根治性脓肿切除。肛周脓肿根治性手术后，因切口不能缝合，恢复期比其它部位感染长，大约为4-6周。如果患者患有糖尿病，愈合时间可延长；年老体弱、营养较差也可影响切口愈合时间。如果肛周脓肿未进行根治性切除，后期可能还需进行肛瘘手术，难以确定愈合时间。