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胃肠间质瘤复发，首先要做进一步的相关检查，即做影像学检查，了解复发部位和血管周围脏器的关系。如果可以，先考虑药物治疗，使肿瘤缩小，在病人各方面情况允许的情况下，再次手术探查治疗，尽量完整切除肿瘤和耐药方面的肿瘤。如果肿瘤继续进展，不能切肿瘤，可以考虑进一步药物治疗，通过药物治疗控制肿瘤，延长病人生命，提高病人生活质量。随着医学的发展，药物方面有很多的新药物产生，包括现在一线的甲磺酸伊马替尼、格列卫，还有舒尼替尼、瑞格菲尼，包括最近国外美国FDA批准的新药物BLU-285，这些新的药物治疗，对于胃肠间质瘤的治疗都有很大帮助。