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复杂性肛瘘是肛肠科的难题，限于目前医学水平、病人整体或病灶局部因素、及保留肛门括约肌功能的需要，手术治疗中并非所有的病例都可以完全治愈，有少部分病例在手术后无法痊愈，其手术效果仅能缩小病灶或改善症状。病灶残留不愈，后期需要带瘘生存，不管是哪种术式都会存在一定复发问题。目前，传统的切后挂线治愈率在90%左右，而保留括约肌的术式治愈率因其方式而不一样，整体在60%-80%之间。保留括约肌的手术治愈率较高的主要是LIFT术式，各种文献报道治愈率在75%-80%之间。LIFT的术式如发生内口较大，或者内口周围组织有感染性蔓延，造成结扎处损伤则易复发。故在脓肿急性发作和炎症期不应该行LIFT手术，应先充分引流，使感染得到控制，窦道形成后再行LIFT术式。另外，应确保瘘管定位准确，否则也易复发。术中游离瘘管时需保留瘘管的完整性，瘘管黏膜层破损也可导致瘘管复发。