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多囊卵巢综合征目前病因不明，可能与遗传因素有关，是遗传因素与后天环境一起作用形成。在询问一些多囊卵巢综合征患者病史的时候，她的母亲或者姐妹可能也有一部分同时存在多囊卵巢病史。还有就是多囊卵巢患者的父亲也可能有男性常见的脱发秃顶情况，那么他的女儿会容易患多囊卵巢综合征。目前该病跟遗传有关，但病因不明，在一些文献当中也有报道多囊卵巢综合征的患者，测出基因是有问题的。但目前未表明是哪种具体基因一定可导致多囊卵巢综合征的发生。