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脑干出血的临床诊断主要是以临床症状为主。主要表现为发病较急骤，发病后很快出现意识障碍、叫不醒、呼吸不规律甚至呼吸骤停以及肌力丧失。个别患者很快出现应激性消化道溃疡，俗称胃出血。主要表现是以意识障碍、呼吸问题为主。诊断手段最常见的是头颅CT，在头颅CT上的表现是在脑干局部或弥漫性的高信号，核磁也会有相应的信号表现。一般通过CT和核磁足以诊断脑干出血，但从核磁上说还有一种特殊类型的脑干出血，比如海绵状血管瘤引起的出血，通过核磁也可鉴别。日常见到最多的脑干出血是由于高血压引起的出血。