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辅酶Q10在临床中常会给心肌炎的患者应用，其能进行氧自由基的清除，对心肌炎的改善有帮助，同时会给心肌修复提供一定的原料，帮助心肌进行恢复改善。如果服用很高剂量的辅酶Q10，偶尔可见胃肠道反应，比恶心、呕吐、腹泻等等，几乎仅见于文献报道，在临床中非常的少见。辅酶Q10是安全性非常好的药物，即使很大剂量服用，胃肠道吸收不后药物就会被排泄掉，所以几乎见不到副作用。偶尔能见到的文献的报道有轻微的消化道的反应，包括恶心、呕吐、腹泻等，还有极少一部分的人群会出现辅酶Q10过敏，这个时候可能表现为身上会有皮疹、药疹，当停药之后或者联合服用抗过敏的药物治疗之后就会得以改善。