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胎儿手脚畸形的原因分很多方面，比如羊膜带综合征、遗传因素等，具体如下：1、羊膜带综合征：如果胎儿手脚畸形是先天性的单侧肢体缺失，比如单侧的手或脚出现问题，可能是羊膜带综合征等此类原因并不清楚的疾病所致；2、遗传：如果胎儿手脚畸形是遗传所致，通常表现为双侧对称性多指、并指、缺指或者短指等。因此如果胎儿是双侧对称性的畸形，考虑遗传因素的可能性大，需要对孕妇及其丈夫进行详细的家系分析，甚至对胎儿进行相应的基因检查，以了解胎儿发生手脚等肢体畸形的原因。