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患者存在深褐色尿液通常提示发生疾病，具体分析如下：1、泌尿系统出血性病变：尿液颜色发暗、发黑，有时表现为红褐色，若发生此类情况，通常为泌尿系统出血性病变，如尿路上皮肿瘤，包括肾盂癌、输尿管癌、膀胱癌等发生出血，导致尿液颜色变深、变红，长时间存在出血则会变为褐色；2、肝胆疾病：当胆道系统或肝脏出现疾病，血液中的胆红素数水平过量增高，导致尿液中排出的胆红素增多，从而导致尿液呈黄褐色。