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小孩子早上起床咳嗽，如果是短期内发生，持续时间不长，考虑感染引起的可能性比较大，常见情况如下：1、病毒感染：常见的病原体包括呼吸道病毒，如合胞病毒、腺病毒、流感病毒、副流感病毒、鼻病毒等；2、细菌感染：如果症状不重可以先口服药物进行止咳化痰对症处理，必要时可以配合雾化吸入的药物进行化痰处理。经过治疗部分患者能逐渐缓解，部分可能没有缓解。如果有细菌感染要选用敏感的抗生素，进行抗细菌治疗；3、支原体、衣原体感染：需要进行对症处理，需要加用大环内酯类药物抗支原体、衣原体；4、过敏性原因：如果经过足疗程抗感染、对症处理，症状没有缓解，早上起床咳嗽，每天都咳，其他时间咳得不多或者其他时间不咳，咳嗽持续1个月以上，要考虑非感染性咳嗽，如与过敏相关的咳嗽变异性哮喘或者过敏性咳嗽。必要时要完善过敏原、肺功能、呼出气一氧化氮等相关检查，进一步明确病因。