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新生儿心肌损伤的主要原因如下：1、缺氧：可以是产前在宫内缺氧即胎儿宫内窘迫，也可以在产时出现窒息，即出生时产道挤压时间过长也可以引起心肌损伤。同时也可以为产后缺氧，产后比如患ARDS即急性呼吸窘迫综合征，或者患新生儿吸入性肺炎，因低氧导致心肌损伤；2、感染：新生儿感染之后，比如患新生儿肺炎、新生儿败血症，也会导致心肌损伤，从而表现为心肌酶增高、心电图ST段改变，再加上心脏超声异常或存在心肌肥厚、心功能减低。还存在部分少见原因，比如先天心脏病，复杂的先心病导致心肌灌注存在异常导致，引起心肌酶增高。新生儿心肌损伤均需及时进行干预，防止进一步发展成心肌炎、心肌病等难以恢复的心脏损害程度。