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肛门透明分泌物通常由大肠分泌，大肠有种细胞叫杯状细胞，可分泌黏液，表现为透明样分泌物。通常正常黏液也有可能随着粪便排出，但大部分人分泌的黏液都被吸收，可能流出较少，具体有以下原因可引起肛门透明分泌物：1、直肠病变：如拉肚子时未曾进食，但仍排出黏液，考虑为大量杯状细胞分泌的黏液，可能是由于肠道有炎症，结构发生改变，透明分泌物增多。直肠肿瘤患者的粪便中可能有黏液，由于局部肠管有病变，受到局部毒性刺激，大肠杯状细胞分泌的黏液吸收减少，则可以流出；2、直肠黏膜脱垂：部分人群可能没有肠炎，也没有直肠肿瘤，分泌少量透明分泌物可能与直肠黏膜脱垂有关，在夜间休息时，可能分泌少量黏液从肛门流出，相对不严重，可以不做特别处理。