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尿液中有黏液丝的原因具体如下：1、生理情况：多数情况下是尿道内的分泌物，即来自尿道腺体的分泌物。如果是女性患者，可能会出现来自阴道的分泌物，此时不需要特殊处理。黏液丝的发生往往在于初始尿，尿中含有来自尿道腺体的分泌物，从而出现黏液丝的升高。同时，也可能混合有来自阴道的分泌物，导致黏液丝的升高。此时泌尿系统没有器质性的病变，患者也没有明显不适症状，所以不需要特殊的处理；2、病理情况：极少数患者会出现尿液中有黏液丝，主要见于炎症、念珠菌感染，或者进行了尿道的操作、急性肾炎。当出现这类问题，往往有伴随症状，可以根据伴随症状判断发生的原因，做出相应的处理。对于黏液丝，在进行妇科检查的时候可以取中段尿，避开初始尿，从而评判是否存在黏液丝的病理性问题。