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无痛胃镜的选择是由麻醉师进行胃镜的筛选，胃镜本身所存在的禁忌症也是无痛胃镜的禁忌症。一般在无痛胃镜的基础上筛选病人，主要在于其心肺功能程度，他是否能够耐受麻醉的程度表现，还有术前预评估。无痛胃镜在患者本人的检查过程需要的时间，并且要预评估到患者是否存在苏醒障碍的问题，经过有效的评估后，筛查患者是否适合。此外，最简单的筛查是心电图评价心脏功能，肝功单来评价患者对麻醉药物的代谢能力等这些方面的情况。如果患者存在严重的心肺疾患，处于不合适的情况，也不适合做无痛胃镜。