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菌群失调通常指阴道内菌群失调，和HPV感染没有关系。阴道内菌群失调，通常跟下列因素有关：1、不正确护理：在日常生活中，有人认为阴道内分泌物都是不利因素，所以每天用洁尔阴或者其他护理液冲洗阴道。反复冲洗之后，就会使阴道内环境遭到破坏，菌群失调，致病菌繁殖，反倒引起阴道局部的炎症性反应；2、糖尿病：可能患有糖尿病，导致体内或阴道内糖原增高，引起体内菌群失调，导致大量念珠菌繁殖；3、长期应用抗生素：可能跟长期应用抗生素有关。如果长期应用抗生素，会使致病菌得到抑制而被杀灭。同时有益菌也会被抑制或杀灭，容易导致菌群失调，引起相应的临床症状。在妇科中，最常见的是容易引起念珠菌感染。所以菌群失调和HPV感染没有关系，而HPV感染属于病毒感染。