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甲胎蛋白偏低在临床上无过多意义，通常不会进行任何处理。甲胎蛋白是胎儿在母体体内产生的特异性蛋白，在胎儿出生2周左右，数值较高。而胎儿出生2周以后，数值降低，甚至可能无法测出，即甲胎蛋白偏低。甲胎蛋白升高常见于肝炎活动期，由于肝细胞受到损伤，血清中的甲胎蛋白可以有所升高。此外，畸胎瘤也可引起甲胎蛋白升高。而患有原发性肝细胞肝癌的患者，甲胎蛋白也可以处于高值水平，但并非肝癌病人均会出现甲胎蛋白升高，出现甲胎蛋白升高的概率为70％-80％。