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肛门疼痛可能和外伤、肛裂或肛瘘等较严重的肛周疾病有关，具体如下：1、外伤：肛门疼痛是临床症状，导致肛门疼痛的原因有时是局部外伤所造成，比如局部磕伤。当出现肛门疼痛时，一般要观察受伤部位有没有发生皮肤破损，或有无异物侵入到局部组织，肛门疼痛大多会随着伤口愈合而逐渐消失；2、肛裂或肛瘘：肛门疼痛有时可能和大便相关，肛门疼痛在排便时会明显。此时需注意对肛门进行手指检查或肛门镜检，明确在肛门内是否出现肛裂或肛瘘，尤其是肛裂，只有治愈肛裂和肛瘘后肛门疼痛才会消失。因此出现肛门疼痛需要积极到医院就诊，必要时进行辅助检查手段，明确肛门疼痛的具体原因。