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透析失衡综合征的发病机理是因为首次透析时透析时间过长，导致患者血液中的毒素下降过快引起的。治疗的方法是针对发病的原因采取措施，把首次透析的时间缩短。病人的毒素特别高，不是单纯的一次透析就把它降到很低，可以连续3天，每天只透2-3个小时，呈阶梯性的下降，这样患者会比较容易达到血液跟脑毒素的平衡，这样就避免了透析失衡综合征的出现。所以在透析室，一般毒素都有700EU/ml以上，这样首次透析的时间定为2小时或者2.5小时，第2天的透析时间定为3小时，第3天的透析时间是3.5-4小时，这样达到稳态的、逐步的下降过程，减少透析失衡综合征的出现。