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咽炎不会影响新型冠状病毒核酸的检测，新型冠状病毒感染后会积聚在呼吸道，呼吸道中有新型冠状病毒增殖，在呼吸道标本中可以检测到新型冠状病毒。核酸检测是通过对呼吸道标本中新型冠状病毒核酸进行检测，从而发现新型冠状病毒的方法。咽炎即本身存在的炎症，不会影响新型冠状病毒核酸检测阳性率。新型冠状病毒核酸检测的阳性率与新冠病毒载量，以及标本取材相关，比如在核酸检测前咀嚼口香糖，由于影响口腔局部的内环境，可能会导致呼吸道标本取材不标准，从而影响新型冠状病毒核酸检测的阳性率，即导致新型冠状病毒不容易被检测出。因此作为咽部本身的疾病咽炎，通常不会影响新型冠状病毒核酸检测的阳性率。