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对于头孢克肟和阿莫西林，无法说明哪种药物更好。医生应根据患者的具体病情以及耐受性的倾向为患者进行选择更为合适的药品，而患者也需遵照医嘱进行规范用药，从而使抗菌药物更好地发挥治疗作用，并且减少耐药现象的发生。而头孢克肟与阿莫西林均属于抗菌药物，具体如下：1、头孢克肟：属于第三代的头孢菌素，并且是广谱的抗菌药物，对革兰氏阳性菌以及革兰氏阴性菌均存在抗菌作用，临床上可以用于治疗呼吸系统、胃肠道、泌尿系统以及其他部位的感染；2、阿莫西林：属于青霉素类的抗菌药物，同样是广谱的抗菌药物，对革兰氏阳性菌以及革兰氏阴性菌均存在抗菌作用。