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支原体肺炎治疗周期为2-3周，支原体引起呼吸道症状较轻。由于支原体病变具有自限性，所以少数患者可以不经治疗而自愈。由于支原体无细胞壁，因此作用于细胞壁抗生素，例如青霉素或头孢霉素对其治疗无效。需要选择大环内酯类药物，例如阿奇霉素或红霉素，喹诺酮类药物也具有效果，例如莫西沙星或左氧氟沙星。可以选择四环素类药物，例如米诺环素或多西环素，治疗周期一般2-3周。 需要根据患者病情轻重调整治疗时间。由于阿奇霉素半衰期较长，常在服药五天后停药两天，然后再服药两天。支原体经过有效治疗可以缩短病程，减轻症状，肺内病灶多数4-6周消散。部分患者咳嗽时间加长，可以采用对症止咳药物和抗过敏药物进行治疗，同时注意休息，避免冷空气和烟雾刺激。