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如果锥切比较完整，HPV感染就在椎切的细胞范围内，外边没有HPV感染，实际上做完手术就应该转阴。但是临床上并不是这样，做完手术后不能筛HPV，因为还处于炎症水肿期，甚至创面还没长好，这时不能用毛刷蹭创面。锥切如果做了缝合，大概要6周缝线才会脱落，创面完全愈合要3个月，因此术后3个月才去查HPV。如果转阴，大概3个月的时候就能查到HPV转阴。临床上也有个别人由于抵抗力升高，虽然在3个月的时候查是阳性，但是到半年的时候，可能由于抵抗力高清除病毒，这个时候才转阴也是有的。锥切以后不是所有的人都能转阴，因为有一些病毒会藏在阴道里或者宫颈剩余的部分里，因此大概60%-70%的人可能会有转阴，有1/3的人还有HPV阳性的可能，甚至有一些病人当时转阴，但是过一段时间又阳性。​有两种可能的原因，一种是潜在的病毒又复制，还有一种可能是性交伴侣会传染到这个病毒，然后再传回给女性。