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良性肿瘤不是癌症，经过手术治疗可以得到治愈，但是在颅脑内疾病中往往会有一些特殊的情况。虽然颅内绝大部分的良性肿瘤，经过手术的全切除以后，都能得到根治，也就是治愈的效果。但是因为颅脑的特殊性，仍然有少部分的良性肿瘤，尽管经过了外科手术的积极治疗后，仍然没能得到根治，也就是还会存在复发。理论上比较常见的是脊索瘤，脊索瘤是胚胎脊索残留组织后续进一步生成的肿瘤，是一种良性肿瘤，但是长的部位比较特殊，长在骨缝里，因此手术一般无法达到全切除，所以会复发。另外还有一些比较大的垂体瘤，或者侵犯范围比较广泛的颅咽管瘤，在进行神经外科手术治疗以后，也有可能会达不到完全切除，因此术后也会复发。还有一些良性肿瘤和一些重要的神经功能结构粘连非常紧密，所以如果勉强全切除肿瘤，可能会引起明显的临床后遗症，这个时候医生也会权衡利弊，可能会残留部分的肿瘤。这部分肿瘤在手术以后，或长或短的时间会有复发，但是复发以后，仍然有再次手术或者进行后续治疗的机会。