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男士染色体有问题是否可以怀孕要具体分析，大部分染色体异常都可以怀孕，但是有少部分情况，可能没有办法采取措施。简单来说，对于染色体异常比较常见的原因，具体如下：一、可以怀孕：1、染色体多肽异常：染色体多肽目前认为和怀孕影响关系不大，这不要紧，可以考虑怀孕，甚至自然试孕；2、染色体结构异常：比如染色体平衡易位、倒位、罗氏易位等，这种情况下可以考虑怀孕，但是会告诉患者这种情况可能会导致流产，或者胎儿畸形，以及生出有问题胎儿的风险增加。此时可以自己去试，碰碰运气，也可以采取第三代试管婴儿，或者产前诊断，来进行进一步的筛选。二、不可以怀孕：有一些比较罕见的男性染色体异常，有可能会导致不孕，比如克氏综合征，就是多了一条X染色体，或者有非常复杂的平衡易位，如3条以上的平衡易位等，此时产生正常精子的可能性非常低，这种情况很不幸，可能没有办法怀孕，必要时甚至可能要做供精，就是用别人的精子，来达到妊娠的目的。因此这个问题不能一概而论，大部分情况可以怀孕，但是可能需要非常专业的医生，来给患者相应的指导和建议，对于男性染色体有问题，建议先去看遗传咨询门诊，尤其是生殖遗传咨询门诊，告诉患者后面的生育方式具体怎么选择，是自己怀孕，还是做试管，还是做三代试管。