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治疗血吸虫病的主要有效药物有吡喹酮、硝硫氰胺。具体如下：1、吡喹酮的应用：吡喹酮是治疗血吸虫病的首选药物。吡喹酮属于广谱的驱虫药，疗程短，副作用少，效果很好，具体用法需要在医生指导下使用，一般急性血吸虫病可能要治疗3天，慢性血吸虫病的治疗疗程为2天。吡喹酮的副作用主要有头晕、乏力、失眠、恶心、呕吐、腹泻等，这些症状一般比较轻，可以自行缓解。有严重心、肾、肝疾病的病人禁用，孕妇禁用；2、硝硫氰胺的应用：硝硫氰胺也是广谱的驱虫药，除治疗血吸虫病外，还可治疗其他疾病比如钩虫病。副作用比较大，主要表现为神经系统和肝脏的毒性，也需要在医生指导下使用。