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儿童基因检测的好处与坏处具体如下：1、好处：对于部分儿童是否患病有一定的预判价值，对于患病高风险的儿童，可以进行有效的预防措施来降低患病率。对于患有疾病的儿童，通过基因检测可以选择有效的治疗方法，控制疾病发展，通过基因检测，还可以确定儿童与父母亲的亲缘关系；2、坏处：很多儿童基因检测价格比较昂贵，目前多为自费，因此，给家庭增加了经济负担，并且部分检测结果也会影响到儿童及家属的心理，给儿童及父母都造成较大的精神压力，并且可能会出现精神损害，临床应该给予重视。