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HLA-B27阴性指此患者不携带有HLA-B27基因，同时细胞表面没有基因表达的蛋白产物。HLA-B27指人类白细胞抗原B27，此基因属于Ⅰ型主要组织相容复合体基因，此基因在机体所有的细胞核上都会表达，尤其是机体中淋巴细胞表面会有表达，若患者表达HLA-B27检测阳性，与强直性脊柱炎有密切关系，在强直性脊柱炎患者中90%的患者基因表达呈阳性，而在一般人群中，HLA-B27阳性比HLA-B27阴性的人群患强直性脊柱炎的几率要明显增加。目前HLA-B27有很多临床亚型，包括100多种，其中HLA-B*27:04和HLA-B*27:05与强直性脊柱炎发病有密切关系，但应注意HLA-B27阳性，并不能确诊是强直性脊柱炎，而阴性也并不能够排除强直性脊柱炎。