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MTX治疗宫外孕的副作用主要包括白细胞下降、肝功能损伤等，具体内容如下：1、白细胞下降：MTX治疗对白细胞，即血常规里的血细胞有杀害作用，所以要看白细胞、红细胞或者血小板有没有降低，特别是白细胞有没有降低，这是MTX治疗的一大危险；2、肝功能损伤：在用MTX治疗的时候，要看肝功能有没有损伤，因为这个药物属于化疗药物，对肝功能也有损伤，所以要考虑肝脏损害。小剂量的MTX对身体的伤害并不大，不要过于担心。虽然在浆细胞疾病、恶性葡萄胎或者绒癌的时候，用的MTX治疗剂量都非常大，还有胃肠道反应或者是骨髓的移植等，但是治疗宫外孕的MTX剂量一般比较小。MTX治疗剂量需要根据公斤体重来算，所以要特别注意其对白细胞的损害，需隔一天复查血常规，来了解其对白细胞的损害，也就是对骨质、骨髓方面的损害。