卵圆孔未闭导致的偏头痛的治疗和原发性偏头痛的治疗一样，疼痛时用解热镇痛药缓解，还可用提高疼痛阈值的药，包括阿米替林等，还可以用抗焦虑的药，如盐酸曲唑酮等。

卵圆孔未闭是心脏中的原发隔和继发隔没有完全闭合导致的，偏头痛是原发性头痛的一种，有研究表明，部分偏头痛和卵圆孔未闭相关。

如果经食道超声证实是卵圆孔未闭引起的偏头痛，此时可以进行卵圆孔未闭的封堵治疗，从而减轻偏头痛。但并不是所有的卵圆孔未闭，都可以导致偏头痛，也不是所有的卵圆孔未闭，经过治疗后，偏头痛就可以完全缓解。

总的来说，卵圆孔未闭导致的偏头痛的治疗，第一要明确是不是卵圆孔未闭导致的偏头痛，第二是治疗包括药物治疗和手术封堵治疗两个部分。手术封堵是一种微创的介入治疗，可以解决部分偏头痛的问题，但不是全部偏头痛的问题。