部分结膜炎会自愈，某些急性细菌性结膜炎和病毒性结膜炎有一定的自愈性，但建议积极的治疗结膜炎。一方面可以减轻症状，缩短病程，避免转化为慢性结膜炎，慢性结膜炎是没有自限性。另一方面及时诊断和治疗，可以防治并发症。因部分结膜炎可以发生睑内翻与倒睫，上睑下垂，睑球粘连，角膜溃疡、混浊，实质性的结膜干燥症，慢性泪囊炎等并发症，症状重者可以严重的影响视力，甚至出现失明的情况。所以，结膜炎还是需要积极的治疗。