肛瘘是由于肛周脓肿破溃或者切开引流后，所产生的后遗症。其与肛周脓肿是属于同一疾病的二个不同阶段，肛周脓肿为急性感染阶段，而肛瘘为慢性感染迁延阶段。肛瘘在肛门周围的皮肤会有肉芽肿性的外口，而在直肠内肛腺处有内口，内口和外口之间有肛瘘的瘘管。

肛瘘平时的主要症状为肛周反复的流脓以及肿痛，由于内口处粪便等感染物质会进入瘘管，所以会导致瘘管出现急性感染而导致局部的肿痛症状。当瘘管内压力增高外口破溃，脓液流出以后疼痛症状会随之缓解，持续反复发作。肛瘘最终都需要通过手术治疗，才能完全治愈。