疱疹性咽峡炎的早期可表现为发热，可达到38℃-40℃，1-2天后，在咽部和软腭可以出现单个或者成簇的小疱疹，直径约2mm，周围有红晕，迅速破溃后形成溃疡，有黄白色纤维素性分泌物覆盖。多个溃疡可融合成不规则的大溃疡。由于疼痛剧烈，宝宝可出现拒食、流口水、烦躁，常因拒食、啼哭才被发现，体温经常在3-5天后恢复正常，病程可以达到1-2周。

所属的淋巴结肿大和压痛可以持续到2-3周，应该保持口腔清洁，多饮水，一般以微凉或者凉的流质食物为宜，避免刺激性的食物。局部可以喷洒西瓜霜、锡类散，疼痛严重的时候可以在餐前用2%的利多卡因涂抹局部，发烧的时候可以用退热剂，可以行全身的抗病毒治疗。