鹅口疮的病因主要是口腔念珠菌感染。在治疗上以抗真菌治疗为主，目前的治疗方法推荐应用制霉菌素，用两片制霉菌素片研成粉末加入20mL甘油混匀，进行口腔涂抹治疗，3-5次/日，睡前用1次，在疗程上不要少于两周。

注意症状消失以后要继续用药，防止疗程不到，病情反复。另外可以结合碳酸氢钠进行治疗，将碳酸氢钠稀释成1.4%液体，每天进行口腔清洁护理，保持口腔局部弱碱性的环境，不利于真菌生长。其次在小儿日常护理上要特别注意奶瓶的消毒，母亲的乳头要注意清洁。