小儿胃肠型感冒主要是由于柯萨奇病毒感染导致的，当小儿胃肠型感冒发烧的时候要监测体温、控制体温，如果体温超过38.5℃可以给予布洛芬混悬液退热治疗，也可以联合物理降温，比如反复的温水擦身将体温控制在正常范围。

同时可以口服藿香正气治疗胃肠型感冒，藿香正气有清热解毒的效果，对胃肠型感冒有非常好的疗效，在临床上应用的也比较广泛。如果通过便常规发现小儿胃肠型感冒合并细菌感染，可以选择头孢克肟、头孢克洛等抗生素进行治疗，饮食上建议进流食，不要吃辛辣、刺激的食物。