急性咽炎和扁桃体炎的区别有以下：

1、病因上，两者都有病毒、细菌感染的可能，但是急性咽炎尤其是急性水肿性咽炎，是由于变态反应（过敏反应）所诱发导致的，扁桃体没有。

2、症状上还是有区别的，急性咽炎的症状总体没有扁桃体炎那么严重，疼痛没有扁桃体炎那么剧烈，当然个别情况下，有的患者比如是急性坏死性咽炎，疼痛也非常明显，但这种疾病已经非常少见了。

3、查体上有区别，急性咽炎主要是表现为咽部，比如前弓、咽后壁、咽峡部等部位的充血以及炎症改变，扁桃体炎主要病变在扁桃体，扁桃体充血、肿大以及扁桃体表面有脓栓形成等相关性改变。

4、治疗上还有区别，急性咽炎需要进行抗病毒治疗，如果有细菌感染，也需要进行抗炎治疗，急性扁桃体炎大多数首选进行抗生素抗炎治疗。