出血热典型的病例中可以有发热期、低血压休克期、少尿期、多尿期和恢复期的五期经过。但是临床上其实非典型的病例比较常见，比如轻型病症，可以有越期的现象，重症病例可能有出现重叠的现象，例如少尿期跟低血压休克期是重叠的。但是在这五个阶段中，最严重的阶段是低血压休克期和少尿期。

在低血压休克期最严重的情况下，可以并发急性呼吸窘迫综合征或急性肾功能衰竭。少尿期非常严重的情况下可以出现高血容量综合征和肺水肿，或者颅内出血以及内脏出血。还有可能出现高分解型的肾功能衰竭，这些情况出现都表示着预后差。